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ServerProtect for Linux ではネットワークドライブの検索除外機能がバージョン2.5より追加され、初期設定ではその検索除外が有効になっています。
そのため、ネットワークドライブについても Scheduled Scan / Manual Scan の検索対象に含める場合には「Use map drive exclusion」 のチェックを外してください。